肠胃道不适、厌食、恶心、腹泻、神经失调、头痛、焦虑、神经质、失眠、昏昏欲睡及倦怠虑弱、流汗、颤抖及目眩或头重脚轻。
不太常见的反应为：头痛、口干、消化不良、呕吐。
其它严重的不良反应偶见报道，例如晕厥、心律失常、非正常肝反应、甲状腺功能减退或亢进、出血时间延长、急性脑部综合征和惊厥。
对盐酸氟西汀胶囊或对本品中任何成分过敏的患者禁用。
单胺氧化酶抑制剂（MAOI）：有报告在接受选择性5-羟色胺再摄取抑制剂（SSRI）治疗的患者同时合并单胺氧化酶抑制剂，包括，选择性MAOI丙炔及可逆的MAOI吗氯贝胺（RIMA）以及近期终止SSRI治疗转而开始单胺氧化酶抑制剂治疗的患者中间出现的严重的、有时甚至是致命的反应。
抽搐发作：同其他抗抑郁药一样，盐酸氟西汀胶囊需慎用于有抽搐发作史的患者。患者发生抽搐发作或抽搐发作频率增加，应立即停药。本品应避免用于不稳定性抽搐发作/癫痫患者，百优解?
如用于控制良好的癫痫病人，则应注意监查。
躁狂症：抗抑郁药应慎用于有躁狂/轻度躁狂病史的患者。同所有抗抑郁药一样，患者发生躁狂，应立即停药。
肝/肾功能：盐酸氟西汀胶囊主要在肝脏代谢，通过肾脏排泄。
对于肝功能紊乱的患者，应降低服用量，如隔日服药。
当每天给予本品20mg，连续两个月，严重肾衰需要透析的患者GFR）血浆中氟西汀及去甲氟西汀的水平于肾功能正常者无差异。
心脏疾病：在一项双盲实验中对312例服用本品患者的心电图进行评估，未见心脏传导阻滞。
然而，对于患有急性心脏疾病的患者服用本品的临床研究尚有限，因此此类病人应慎用。
体重减轻：盐酸氟西汀胶囊可能导致体重减轻，但通常与基线体重成比例。在临床实验中，无论体重正常抑或体重偏轻的患者，服药过程中发生的体重减轻均无临床意义。
糖尿病：糖尿病患者服用SSRI可影响血糖浓度。
服用本品期间可能会出现低血糖，停药后继而出现高血糖。应调整胰岛素和口服降糖药的剂量。
自杀：治疗最初数周内可能疗效不明显，同其他抗抑郁药一样，在此期间应密切监护患者。
抑郁症患者常见消极情绪并有自杀企图，这种现象可能会一直持续，直至症状有明显好转。临床经验表明，在恢复的最初阶段，自杀的风险可能会增加。
出血：已有报道服用SSRI的患者出现皮肤出血，如瘀癍和紫癜。在服用本品的患者中，瘀癍少有报告。其他出血表现（如，妇科出血，胃肠出血及其他皮肤或黏膜出血）罕有报告。
需提醒服用SSRI的患者注意，尤其是于已知影响血小板功能的药物（如，非典型的安定药，诸如氯氮平，吩噻嗪，决大多数三环抗抑郁药，阿司匹林，非甾体类抗炎药）合用及用于有出血史的病人时，更须引起注意。
警告皮疹和过敏反应：皮疹，过敏反应和进一步的全身反应，有时非常严重（包括皮肤、肾、肝和肺），已有报告。
如果出现皮疹或者其他可能的过敏现象而不能确定病因时，应停止服用本药。
孕妇：尚不清楚盐酸氟西汀胶囊对人类妊娠的影响。但是，因为氟西汀能够透过胎盘且可能对新生儿具有不良影响，如必须使用本品，需权衡利弊。
乳母：本品可以分泌至母乳。尚未肯定对婴儿的影响。如果必须服用氟西汀，建议停止哺乳。分娩：尚不清楚本品对人类分娩的影响。
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