多数情况下做完咽拭子后不会造成咽炎，但如果做咽拭子后咽喉破损或过量饮酒，则可能会引起咽炎。此时应做好饮食护理，并在医生的指导下服用药物改善病情。
咽拭子通常需要对咽喉处的分泌物进行取样，经特定仪器来判断受检者是否存在疾病。咽喉组织较为敏感，有些人做咽拭子后可能会出现咽喉疼痛、发痒等症状，但此类不适感较轻微，多喝温水、休息一段时间后就可以自行好转。而且采集者的动作多数情况下比较轻柔，并不会损害、刺激咽喉组织，此时做咽拭子通常不会引发咽炎，不用过于担忧。
但如果做咽拭子时动作过于粗暴，导致咽喉组织发生破溃，则较容易受到病原体侵袭。另外，如果做咽拭子后大量喝酒，则会使咽喉黏膜受到刺激，此时可能就会诱发咽炎，导致该处组织肿胀、充血、疼痛，使得患者出现咽痛、咳嗽、口腔异味、恶心等症状，此时应配合医生选择复方硼砂溶液、冰硼散、左氧氟沙星片、黄连上清丸等药物进行治疗。
做咽拭子前应避免摄入太多食物，以防刺激咽喉组织后诱发呕吐的症状。平日应尽量少进食酸辣粉、白酒等刺激性大的食品，按时休息，适度运动，有益于个人健康。
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