深圳市妇幼保健院建于1979年，是一家集医疗、保健、教学、科研、预防为一体的国内知名三级甲等妇幼保健院，现为南方医科大学非直属附属医院以及多所高等院校教学医院和实习基地。
医院一院两址，分别为红荔院区和福强院区，占地面积3.5万平方米，建筑面积15万平方米，医院床位1300张。
年门急诊量200万余人次，出院人数近5万人，分娩量近2万例。 截至2022年8月，全院在岗职工2233人，卫生专业技术人员1977人，占全院职工88.54%；正高142人，副高303人，博士77人，硕士519人，博士生导师5人，硕士生导师47人。
目前拥有地方级领军人才4人，“孔雀计划”C类人才7人，临床型实用人才2人，后备级人才5人。
医院设有产科、妇科、新生儿科、儿科（含儿外科）、生殖医学中心、生殖免疫综合科、中医科、针灸推拿科、乳腺科、口腔病防治中心、急诊科、麻醉科、医学遗传中心、检验科、病理科、放射科、超声科、药剂科、产前诊断中心、妇女保健科、儿童保健科、新生儿疾病筛查中心、儿童听力诊断中心、宫内疾病诊疗中心、聚焦超声无创治疗中心、儿童神经康复中心、宫颈癌早诊早治中心、乳腺癌防治中心等30多个业务科室；具有第三代试管婴儿技术（胚胎植入前遗传学筛查技术，PGT）正式运行资质。
院党委重视党建工作，坚持把方向、管大局、作决策、促改革、保落实的领导作用；突出党的政治建设，以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，强化理论武装，做好思想宣传，落实意识形态工作责任制；提出“以品牌促党建.以党建促发展”的党建工作思路，创建“党心聚力 服务‘医’线”党建特色品牌，打造精品项目，推进党建创新，以党建引领医院高质量发展；深化党支部标准化、规范化建设，抓好党员队伍建设，充分发挥党组织的战斗堡垒和党员的先锋模范作用；纵深推进全面从严治党，持续抓好党风廉政建设和行风建设；加强统战工作，充分发挥群团组织作用，定期举办文艺汇演、歌手大赛及“青年论坛”等活动；院工会成立多个兴趣小组，努力打造职工和患者喜闻乐见的文化品牌，为医院建设和发展铸魂立魄。
目前已在全市建立以深圳市妇幼保健院为龙头，各区妇幼保健院为支撑，由市、区妇幼保健院、综合医院、社康中心组成的两级三层妇幼保健网络，保障全市各项妇幼指标持续向好，全市孕产妇死亡率、围产儿死亡率保持全国领先水平，全市妇女儿童健康水平稳居全国前列。
近几年在各级综合绩效考核及评价中获得优异成绩。
2020年度广东省三级妇幼保健机构绩效考核，名列全省第一；2020年度国家卫生健康委首次全国妇幼保健机构绩效考核，名列全国第五。
中国医院科技量值（STEM）排行榜中，妇产科学连续多年位列百强；2020年荣登艾力彼中国医院竞争力排行榜“粤港澳大湾区最佳医院100强”第68位，入围“智慧医院HIC300强”；2021年荣登“妇产医院50强”第28位，“儿童医院50强”第27位，“智慧医院HIC专科医院60强”第25位。
医院技术力量雄厚，组建深圳市妇幼医学研究所，打造医院公共科研服务平台和专职科研队伍，科研水平显著提高。
近年来承担了多项国家重点研发计划、国家自然科学基金重点项目等重大科研项目，省市级科研课题立项屡创新高。
获中华医学科技奖、广东省科技进步奖、深圳市科技进步奖多项。
2019年获国家卫健委医政医管局“科技兴院典型”奖。
2021年获得国家卫生健康委“2018-2020改善医疗服务示范医院-以‘互联网+’为手段，建设智慧医院的先进典型”。
学科建设稳步推进，专科影响力不断提升，拥有1个国家临床重点专科：新生儿科；1个国家保健特色专科：孕产期保健特色专科；1个广东省高水平临床重点专科：新生儿科；2个广东省保健特色专科：新生儿保健特色专科、更年期保健特色专科；1个广东省中医重点专科：中医妇科；4个深圳市医学重点专科：产科、新生儿科 、生殖医学科、妇幼卫生与儿童保健专科；1个深圳市重点实验室：深圳出生缺陷预防控制重点实验室；1个深圳市中医特色专科:中西医结合妇科。
拥有全国首批产前超声培训基地、全国新生儿围产期医学专科医师培训基地、全国子宫颈癌早诊早治示范基地、国家级儿童早期发展示范基地等多个国家级基地。
首创妇幼特色专科技能妇幼医学培训基地，成为全国首家产科高级生命支持模拟培训基地（ALSO）。
“医疗卫生三名工程”项目稳步推进。
2016至2018年共引进8个“三名工程”团队，在引进团队的指导下，依托科室在医、教、研、管、防等方面均取得明显进步，学科水平显著提升。
医院是国家药物/医疗器械临床试验机构，现已备案有妇科、新生儿科、医学遗传中心、检验、口腔、皮肤科等具有妇幼特色的药械专业组10余个，承接项目逐年递增，机构备案以来多次通过广东省、江苏省等省级药监部门的监督检查及项目核查，均获得高度评价。
面对新征程，医院将秉承“保障母婴安康、提高出生人口素质”的办院宗旨，弘扬“团结、耐劳、慎独、向上”的院训精神，大力推进医院学科建设和人才培养，实现我院医疗、教学和科研全方位发展，努力构建国内一流的集约型、服务型、创新型妇幼保健服务体系，向“树立市妇幼优质品牌，打造广深医疗高地，创建粤港澳大湾区妇幼保健医疗中心，推进健康深圳建设”的目标努力奋斗。
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