附属医院专业设置齐全，共设21个科室，35个专业，心血管内科和心胸血管外科为空军医学专科研究中心，耳鼻咽喉科、消化内科、神经内科、普通外科、妇产科、老年医学与保健、急救医学与门诊管理、皮肤病学、中医药专业、理疗专业、医学检验、放射诊断、药学专业、航空医学、医院管理、继续医学教育、护理专业、卫生信息与应用等17个专业学科
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