7月27日，南京市疾病对策中心副主任丁洁在南京市疫情对策发表会上表示，本轮南京疫情病毒基因序列结果显示为德尔塔(Delta)毒株。
在印度率先发现的德尔塔毒株，已成为愈来愈多国家的新增病例主流，已有超过100个国家和地区报告了德尔塔毒株的感染病例。国内此前出现的广东疫情、云南瑞丽疫情，均被证实是由不同突变位点的德尔塔毒株引发的，基因测序结果显示其具有高度同源性，而传播力强成为德尔塔毒株的最显著特征。
医学预印本网站medrxiv7月23日发表了广东疾病对策中心等团队的研究，该研究由广东省疾病对策中心副主任、首席专家何剑锋等完成，研究结果显示，德尔塔毒株在中国首次局部传播中，可能具有更快的病毒复制能力和更强的传染性，相关德尔塔毒株确诊病例的病毒负荷是2020年19A/19B分支的新冠状病毒负荷的1260倍。
该研究论文名为《Viral infection and transmission in a large, well-traced outbreak caused by the SARS-CoV-2 Delta variant（由新冠德尔塔毒株引起的，大规模爆发的，追踪良好的病毒感染与传播）》。
5月21日，广州疫情第一例相关病例确诊，截至6月18日报告的最后一例，本次广州疫情期间共确定167例当地疫情，研究团队表示，所有病例都可以从疫情学或遗传学追溯到第一指示病例。
研究团队研究了被集中隔离的密切接触者每日的PCR检测数据，以便确定他们从接触到首次检测出病毒载量之间的时间间隔，结果显示为4天(共34人被检测出新冠病毒，时间间隔的峰值为第3.71天），而在由A/B遗传分支菌株造成的2020年疫情中，这一数据是6天。
研究团队还评估了确诊病例首次被PCR检测出新冠病毒时的病毒载量值，广州疫情病例中德尔塔毒株的载量 (共62个样本)是2020年19A/19B分支病毒载量(共63个样本)的1260倍。
上述数据显示，德尔塔毒株具有更快的复制速度和感染初期可能具有更强的感染性。
研究指出，个人感染后经历潜伏期，其间病毒滴度过低无法检测。随着病毒在宿主内持续增殖，病毒负荷最终达到可检测水平，个人具有传染性。因此，了解感染者何时可以传播对于设计打破传播链的干预策略至关重要。对隔离对象的调查显示，对于德尔塔毒株，从曝光到检测病毒的时间窗口约为3.7天，与早期病毒谱系相比，初次检测病毒时的传播风险更高。
研究表明，广东省最初要求从机场、车站、汽车站离开广州市的人出示72次小时内新冠核酸检测阴性证明书，6月7日缩短为48小时内新冠核酸检测阴性证明书。相比之下，2020年的相关要求是7天内新冠核酸检测的阴性证明书。
考虑到德尔塔毒株在世界范围内越来越流行，研究团队建议相关预防管理必须进行相应的调整，以应对病毒的传播速度。例如，人们的核酸检测、发现感染症状前的隔离、病毒基因组的监测水平等。
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