防洪费应计入管理费用。防洪费会计处理如下：借：管理费用——小税种，贷：其他应付款——防洪费（或应交税费科目）。交纳时：借：其他应付款——防洪费（或应交税费科目），贷：银行存款。直接缴纳防洪费时：借：管理费用——防洪费，贷：银行存款。
防洪费也有叫堤围费或围堤费的（因刚开始时叫防洪费，后改为堤围防护建设费，习惯上称防洪费）。是按照企业的销售收入的一定比例（各省市不同）由地税部门收取的专门用来防洪（堤围）建设的费用。
它在企业的管理费用中列支，每半年申报征收一次。有的地方比如天津市，防洪费是按照增值税、营业税、消费税的1%来提取的，并且是每月都要申报。
防洪费按照计征流转税的应纳税营业额或销售额进行计算征收，如果没有应税收入，应该进行零申报。其计算公式为：应缴防洪费=销售（营业）收入×适用比率。
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